凈化工程空氣除菌錯失有以下幾種：
（一）、熱滅菌法
空氣在進入培養(yǎng)系統(tǒng)之前，一般均需用壓縮機壓縮，提高壓力，空氣經(jīng)壓縮后溫度能夠升到200℃以上，保持一定時間后，便可實現(xiàn)干熱殺菌。
（二）、輻射滅菌
輻射滅菌的原理是α射線、X射線、β射線、γ射線、紫外線、超聲波等從理論上講都能破壞蛋白質(zhì)，破壞生物活性物質(zhì)，從而起到殺菌作用。應用范圍通常用于無菌室和醫(yī)院手術室。缺點是殺菌效率較低，殺菌時間較長。一般要結(jié)合甲醛蒸汽等來保證無菌室的無菌程度。
（三）、靜電除菌
近年來一些工廠已使用靜電除塵器除去空氣中的水霧、油霧和塵埃，同時也除去了空氣中的微生物。對Iμm的微粒去除率達99％，消耗能量小，每處理1000m3的空氣每小時只耗電0.4~0.8kW?？諝獾膲毫p失小，一般僅（3~15）×133.3Pa。但對設備維護和安全技術措施要求較高。
靜電防塵是利用靜電引力來吸附帶電粒子而達到除塵、除菌的目的。懸浮于空氣中的微生物，其孢子大多帶有不同的電荷，沒有帶電荷的微粒進入高壓靜電場時都會被電離變成帶電微粒。但對于一些直徑很小的微粒，它所帶的電荷很小，當產(chǎn)生的引力等于或小于氣流對微粒的拖帶力或微粒布朗擴散運動的動量時，則微粒就不能被吸附而沉降，所以靜電除塵對很小的微粒效率較低。
用靜電除菌凈化空氣有如下優(yōu)點：
（1）阻力小，約1.01325×104Pa；
（2）染菌率低，平均低于10~15％； 
（3）除水、除油的效果好；
（4）耗電少。缺點是設備龐大，需要采用高壓電技術，且一次性投資較大；對發(fā)酵工業(yè)來說，—其捕集率尚嫌不夠，需要采取其它措施。
（四）、介質(zhì)過濾除菌法
介質(zhì)過濾除菌法是讓含菌空氣通過過濾介質(zhì)，以阻截空氣中所含微生物，而取得無菌空氣的方法。通過過濾除菌處理的空氣可達到無菌，并有足夠的壓力和適宜的溫度以供好氧培養(yǎng)過程之用。該法是目前廣泛應用來獲得大量無菌空氣的常規(guī)方法。常用的過濾介質(zhì)有棉花；活性炭或玻璃纖維、有機合成纖維、有機和無機燒結(jié)材料等。由于被過濾的氣溶膠中微生物的粒子很小，一般只有0.5~2μm，而過濾介質(zhì)的材料一般孔徑都大于微粒直徑幾倍到幾十倍，因此過濾機理比較復雜。
隨著工業(yè)的發(fā)展，過濾介質(zhì)逐漸由天然材料棉花過渡到玻璃纖維、超細玻璃纖維和石棉板、燒結(jié)材料（燒結(jié)金屬、燒結(jié)陶瓷、燒結(jié)塑料）、微孔超濾膜等。而且過濾器的形式也在不斷發(fā)生變化，出現(xiàn)了一些新的形式和新的結(jié)構，把發(fā)酵工業(yè)中的染菌控制在極小的范圍。